Servicios

BIOINFORMÁTICA

ibmcp - servicio bioinformatica

Personal

Javier Forment · Responsable del Servicio

Contacto

jforment@ibmcp.upv.es

Horario

Descripción

El Servicio de Bioinformática del IBMCP proporciona a los investigadores del IBMCP y a organizaciones externas la infraestructura de hardware, las herramientas computacionales y la experiencia en el campo necesarios para la moderna investigación biológica. Los servicios prestados incluyen:

1) Servicios de consultoría a los investigadores para el planteamiento de actividades bioinformáticas en la solicitud de financiación de proyectos y en la planificación de sus experimentos con vistas a un adecuado tratamiento bioinformático posterior.

2) Análisis y almacenamiento de grandes conjuntos de datos obtenidos mediante las modernas técnicas de alto rendimiento, principalmente NGS.

3) Desarrollo de herramientas, páginas web y bases de datos específicas.

4) Administración y soporte para usuarios directos de los recursos computacionales del IBMCP.

5) Resolución de necesidades bioinformáticas puntuales diferentes de las arriba listadas (preparación de scripts, ayuda en la localización y uso de bases de datos, programas y servicios web bioinformáticos externos, envío de datos a repositorios públicos, ayuda en la escritura de artículos, etc.)

La tarifa de los servicios depende del trabajo humano realizado, los tiempos de computación y el espacio de almacenamiento en disco. Para obtener una estima del precio de un servicio escribir a jforment@ibmcp.upv.es.

 

 

Equipamiento

 

- Servidor Bull NovaScale R440, con 2 procesadores Intel Xeon de doble núcleo a 2 GHz, 4 GB RAM, con un armario de discos (sistema de almacenamiento SAS), para alojamiento y servicio de bases de datos y páginas web, y almacén de copias de seguridad.

 

- Cluster de PCs constituido por 25 nodos de computación, para computación distribuida y servicio a usuarios:

    - 2 nodos, cada uno con 2 procesadores Intel Xeon de cuádruple núcleo a 2.0 GHz, 32 GB RAM, y 160 GB de almacenamiento en disco

    - 4 nodos, cada uno con 2 procesadores Intel Xeon de cuádruple núcleo a 2.0 GHz, 24 GB RAM, y 160 GB de almacenamiento en disco

    - 2 nodos, cada uno con 2 procesadores Intel Xeon de cuádruple núcleo a 2.0 GHz, 16 GB RAM, y 160 GB de almacenamiento en disco

    - 4 nodos, cada uno con 2 procesadores Intel Xeon de cuádruple núcleo a 2.0 GHz, 8 GB RAM, y 160 GB de almacenamiento en disco

    - 8 nodos, cada uno con 4 procesadores Intel Xeon de doble núcleo a 2.66 GHz, 2 GB RAM, y 80 GB de almacenamiento en disco

    - 5 nodos, cada uno con 2 procesadores Pentium III a 1 GHz, 1.5 GB RAM, y 40 GB de almacenamiento en disco.

 

- Servidor IBM OpenPower720, con 4 procesadores Power5 de doble núcleo a 1.8 GHz, 8 GB RAM, para calculos intensivos y almacen de copias de seguridad.