Research groups

Grupo: Plant Virus Biotechnology

Plants host a large variety of infectious agents that frequently cause enormous damage in crops and natural ecosystems. The first goal of our research group is to understand the molecular mechanisms that underlie the interaction between plants and some of these pathogens, such as viruses and viroids. From this knowledge we expect to develop new biotechnological strategies for crop protection and innovation. In addition, we believe that we can take advantage of the remarkable biological properties of plant viruses and viroids by converting them into useful biotechnological devices. Our second goal is to develop systems to produce products of interest (metabolites, RNAs, proteins, antibodies...) in biofactory plants using conveniently engineered viruses and viroids. We envision a future in which cultivated plants will be the most reliable and sustainable source of food, feed, fibers, fuel, and pharmaceutical and chemical products for human kind.

More specifically, some of the ongoing projects in our research group aim to:

1. Decipher how viroid RNAs are able to replicate in plant cells. See Cordero et al. 2018, Front. Microbiol.

2. Understand the plant defensive response to virus infection. See Cordero et al. 2017, Mol. Plant Microbe Interact.

3. Identify resistance genes to virus infection. See Aragonés et al. 2018, Eur. J. Plant Pathol.

4. Develop biotechnological strategies to protect plants against virus and viroids. See Carbonell et al. 2017, Mol. Plant Pathol.; or Carbonell et al. 2018, Mol. Plant Microbe Interact.

5. Produce health promoting carotenoids and anthocyanins in plants using viral vectors. See Majer et al. 2017, Sci. Rep.; or Cordero et al. 2017, Front. Microbiol.

6. Produce large amounts of recombinant RNAs using a viroid-based vector system. See Daròs et al., Sci. Rep.

7. Develop viral vectors to produce recombinant proteins in plants. See Majer et al. 2015, Biotechnol. J.; or Shi et al. 2018, Plant Biotech. J.

8. Build synthetic gene circuits to regulate gene expression in plants. See Cordero et al. 2018, ACS Synth. Biol.

Plant Virus Biotechnology 2015

Staff Researchers

Other Group Members

Technicians

  • Carbonell, A (2019)
    Design and high-throughput generation of artificial small RNA constructs for plants. In: Plant MicroRNAs: Methods and Protocols
    Methods in Molecular Biology 1932: 247-260
  • Carbonell, A. and Daròs, J.A (2019)
    Design, Synthesis, and Functional Analysis of Highly Specific Artificial Small RNAs With Antiviral Activity in Plants. In: Antiviral Resistance in Plants: Methods and Protocols
    Methods in Molecular Biology 2028: 231-246
  • Carbonell, A., López, C. and Daròs, J.A (2019)
    Fast-forward identification of highly effective artificial small RNAs against different Tomato spotted wilt virus isolates
    Molecular Plant-Microbe Interactions 32 (2): 142-156
  • Luis Cervera-Seco, María Carmen Marqués, Alejandro Sanz-Carbonell, Joan Márquez-Molins, Alberto Carbonell, José-Antonio Daròs and Gustavo Gómez (2019)
    Identification and characterization of a stress-responsive TAS3-derived tasiRNA in melon
    Plant and Cell Physiology 60 (11): 2382-2393
  • Carbonell, A., Purificación Lisón and Daròs, J.A (2019)
    Multi-targeting of viral RNAs with synthetic trans-acting small interfering RNAs enhances plant antiviral resistance
    The Plant Journal 100: 720-737
  • Carbonell, A (2019)
    Secondary small interfering RNA-based silencing tools in plants: an update
    Frontiers in Plant Science 10: 687
  • Carbonell, A (2017)
    Immunoprecipitation and high-throughput sequencing of ARGONAUTE-bound RNAs from plants. In: Plant Argonaute Proteins: Methods and Protocols
    Methods in Molecular Biology 1640: 93-112
  • Kénesi, E., Carbonell, A., Lózsa, R., Vértessy, B. and Lakatos, L (2017)
    A viral suppressor of RNA silencing inhibits ARGONAUTE 1 function by precluding target RNA binding to pre-assembled RISC
    Nucleic Acids Research 45 (13): 7736-7750
  • Carbonell, A. and Daròs, J.A (2017)
    Artificial microRNAs and synthetic trans-acting small interfering RNAs interfere with viroid infection
    Molecular Plant Pathology 18 (5): 746-753
  • Carbonell, A (2017)
    Artificial small RNA-based strategies for effective and specific gene silencing in plants
    Plant Gene Silencing: Mechanisms and Applications 6: 110-127.
Daròs, J.A. (2016)
Viroids: small noncoding infectious RNAs with the remakable ability of autonomous replication.
In Current Research Topics in Plant Virology (editores Aiming Wang and Xueping Zhou). Springer International Publishing Switzerland 2016. ISBN: 978-3-319-32917-8, ISBN: 978-3-319-32919-2 (eBook), DOI: 10.1007/978-3-319-32919-2.
Entidad financiadora: 
Generalitat Valenciana
IP: 
Santiago Francisco Elena Fito
Entidad financiadora: 
Comisión Europea (Acción Marie Sklodowska-Curie)
IP: 
Alberto Carbonell Olivares/José Antonio Darós Arnau
Entidad financiadora: 
MINECO
IP: 
José Antonio Darós Arnau
Entidad financiadora: 
Syngenta Crop Protection, LLC
IP: 
José Antonio Darós Arnau
Entidad financiadora: 
INVESTIGACIONES Y APLICACIONES BIOTECNOLÓGICAS S.L.
IP: 
José Antonio Darós Arnau
Entidad financiadora: 
Generalitat Valenciana
IP: 
José Antonio Darós Arnau
Entidad financiadora: 
MINECO
IP: 
José Antonio Darós Arnau
Entidad financiadora: 
MICINN (MINECO)
IP: 
José Antonio Darós Arnau
Entidad financiadora: 
Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (Gobierno de España)
IP: 
José Antonio Darós Arnau
Entidad financiadora: 
Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (Gobierno de España)
IP: 
José Antonio Darós Arnau
Entidad financiadora: 
Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (Gobierno de España)
IP: 
José Antonio Darós Arnau
Título: 
Recombinant RNA production
Fecha de solicitud: 
Tuesday, 20 May, 2014
Autores: 
Darós, J.A., V. Aragonés and M.T. Cordero.
Título: 
Vector para la coexpresión de varias proteínas heterólogas en cantidades equimolares
Fecha de solicitud: 
Tuesday, 9 March, 2010
Autores: 
Darós, J.A., L. Bedoya y F. Martínez.
Título: 
Reactor para el empleo de enzimas inmovilizadas en reacción de flujo continuo (FIA) en medios orgánicos no acuosos.
Fecha de solicitud: 
Friday, 16 July, 1993
Autores: 
De la Guardia, M.A., A.E. Morales y J.A. Darós.
Título: 
Separador circular de fases para diálisis y extracción líquido-líquido en línea.
Fecha de solicitud: 
Thursday, 16 April, 1992
Autores: 
De la Guardia, M.A., J.V. de Julián, J.A. Darós y S. Garrigues
Metabolic engineering of plants using a disarmed potyvirus vector.
Año: 
2016
Nombre: 
Eszter Majer
Universidad: 
Universidad Politécnica de Valencia
Dirigida por: 
José Antonio Darós Arnau
Tipo: 
Tesis Doctorales
Análisis de la dinámica de replicación de un virus de RNA de plantas y del uso de microRNAs artificiales como estrategia antiviral
Año: 
2014
Nombre: 
Martínez García, Fernando
Universidad: 
Universitat Politecnica de Valencia
Dirigida por: 
Dr. José Antonio Darós Arnau y Prof. Santiago Francisco Elena Fito (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia)
Tipo: 
Tesis Doctorales
Construcción de clones infecciosos del virus del mosaico amarillo del calabacín.
Año: 
2014
Nombre: 
Cerdán García, Lidia
Universidad: 
Universidad Politécnica de Valencia
Dirigida por: 
Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia). Tutor: Dr. Carmelo López del Rincón (COMAV, Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: 
Trabajos de Fin de Carrera
Resistance to virus infection mediated by artificial microRNAs: estimating the likelihood of escape mutants.
Año: 
2013
Nombre: 
Lafforgue, Guillaume Charles G
Universidad: 
Universitat de València
Dirigida por: 
Prof. Santiago Francisco Elena Fito y Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: 
Tesis Doctorales
Optimización del sistema reportero visual para el seguimiento de la infección de virus en plantas basado en el factor de transcripción Rosea1
Año: 
2013
Nombre: 
Ortiz Sánchez, David
Universidad: 
Universidad Politécnica de Valencia
Dirigida por: 
Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia). Tutor: Dr. Carmelo López del Rincón (COMAV, Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: 
Trabajos de Fin de Carrera
Evaluación del factor de transcripción Ant1 de tomate como marcador reportero de la infección viral en plantas
Año: 
2013
Nombre: 
Saura Sánchez, María Teresa
Universidad: 
Universidad Politécnica de Valencia
Dirigida por: 
Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia). Tutor: Dr. Carmelo López del Rincón (COMAV, Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: 
Trabajos de Fin de Carrera
Estudio de los dominios funcionales de la proteína P1 de los potyvirus mediante mutagénesis por deleción
Año: 
2013
Nombre: 
Torres Borja, Paula
Universidad: 
Universidad Politécnica de Valencia
Dirigida por: 
Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia). Tutor: Dr. Carmelo López del Rincón (COMAV, Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: 
Trabajos de Fin de Carrera
Clonación y secuenciación de la RNA polimerasa cloroplástica de berenjena codificada en el núcleo para estudiar su posible implicación en la replicación del viroide latente de la berenjena
Año: 
2013
Nombre: 
Senabre López, Irene
Universidad: 
Universidad de Valencia
Dirigida por: 
Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: 
Trabajos de Fin de Carrera
Clonación y expresión de proteínas del virus del bronceado del tomate (TSWV) en plantas de Nicotiana benthamiana mediante un vector de expresión derivado del virus del grabado del tabaco (TEV).
Año: 
2012
Nombre: 
Tudela Martínez, Julia María
Universidad: 
Universidad Politécnica de Valencia
Dirigida por: 
Dr. Carmelo López del Rincón (Universidad Politécnica de Valencia) y Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: 
Tesis de Master
Anàlisi molecular de la malastía de les fulles trencadisses de la palmera de dàtils: RNA, proteïnes i bacteries de la rizosfera.
Año: 
2011
Nombre: 
Marqués Signes, Jorge
Universidad: 
Universitat de València
Dirigida por: 
osé Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia) y Dra. Nuria Durán-Vila (Instituto Valenciano de Investigaciones Agrarias, Moncada).
Tipo: 
Tesis Doctorales