Research groups

Grupo:  Molecular Regulatory Circuits in Response to Osmotic Stress

Interés

Descifrar los mecanismos moleculares y los distintos niveles fisiológicos que componen la adaptación a estrés osmótico en células eucariotas.

Líneas de investigación

Análisis bioquímico y genómico de la respuesta transcripcional de la levadura Saccharomyces cerevisiae a estrés osmótico

La ruta de señalización HOG (High Osmolarity Glycerol) responde específicamente a estrés osmótico con la activación de su MAP quinasa Hog1 y coordina una compleja respuesta de adaptación. La respuesta implica la activación transcripcional de una gran cantidad de genes en el núcleo. Otras proteína quinasas como Sch9 participan en la respuesta transcripcional. Hog1 y Sch9 actúan al nivel de la cromatina de los genes de defensa al estrés. Nuestro grupo investiga el reclutamiento de las quinasas al genoma en condiciones de estrés por inmunoprecipitación de la cromatina (ChIP) al nivel de genes específicos y al nivel genómico (ChIP on Chip). Los mecanismos de la activación transcripcional son complejos e involucran la modificación de factores específicos de la transcripción, el reclutamiento de co-represores y co-activadores de transcripción, la modificación de histonas y la modulación de la actividad del complejo de elongación de la RNA polimerasa II.  En la respuesta a estrés osmótico participan numerosos factores de transcripción como Sko1, Hot1, Smp1, Msn2, Msn4 y otros. El análisis de estos factores por ChIP y ChIP on Chip identifica los blancos directos de cada uno de ellos para comprender las funciones de los factores de transcripción en esta respuesta compleja a estrés. 

Regulación de la actividad mitocondrial en respuesta a estrés salino

Recientemente hemos podido identificar la función mitocondrial como factor esencial en la adaptación correcta a estrés salino. Empleando técnicas genéticas, bioquímicas y proteómicas tratamos de identificar los componentes de la mitocondria y sus funciones específicas que son modulados durante la adaptación a salinidad. 

Estudio in vivo de la asociación de factores de transcripción y del reclutamiento de quinasas reguladoras de la transcripción en respuesta a estrés salino en cultivos celulares de Arabidopsis thaliana

La conservación entre rutas de MAP quinasas de levaduras y plantas superiores ha permitido identificar la ruta de señalización involucrada en la respuesta a estrés osmótico en Arabidopsis thaliana. Proponemos establecer la tecnología de la inmunoprecipitación de la cromatina (ChIP y ChIP on Chip) para las moléculas involucradas en la respuesta transcripcional a estrés osmótico en Arabidopsis thaliana. El sistema experimental consiste en la expresión transitoria de las moléculas de interés como fusiones con múltiples epítopos en protoplastos de Arabidopsis y su cuantificación por ChIP en distintas condiciones de estrés salino y osmótico.

Circuitos Moleculares en Respuesta a Estrés Osmótico

Staff Researchers

  • Vanacloig-Pedros E, Bets-Plasencia C, Pascual-Ahuir A, Proft M (2015)
    Coordinated Gene Regulation in the Initial Phase of Salt Stress Adaptation

    Journal of Biological Chemistry 290: 10163-10175

  • Rienzo A,Poveda-Huertes Dl,Aydin S,Buchler NE, Pascual-Ahuir A, Proft M (2015)
    Different Mechanisms Confer Gradual Control and Memory at Nutrient- and Stress-Regulated Genes in Yeast

    Molecular and Cellular Biology 35: 3669-3683

  • Pascual-Ahuir A, Vanacloig-Pedros E, Proft M (2014)
    Toxicity mechanisms of the food contaminant citrinin: application of a quantitative yeast model

    Nutrients 6: 2077-2087

  • Martínez-Montañés F, Rienzo A, Poveda-Huertes D, Pascual-Ahuir A, Proft M (2013)
    Activator and Repressor Functions of the Mot3 Transcription Factor in the Osmostress Response of Saccharomyces cerevisiae

    Eukaryotic Cell 12: 636-647

  • Dolz-Edo L, Rienzo A, Poveda-Huertes D, Pascual-Ahuir A, Proft M (2013)
    Deciphering Dynamic Dose Responses of Natural Promoters and Single cis Elements upon Osmotic and Oxidative Stress in Yeast

    Molecular and Cellular Biology 33: 2228-2240

  • Timón-Gómez A, Proft M, Pascual-Ahuir A (2013)
    Differential regulation of mitochondrial pyruvate carrier genes modulates respiratory capacity and stress tolerance in yeast

    PLoS ONE 8: e79405

  • Pascual-Ahuir A, Proft M (2012)
    Quantification of Protein-DNA Interactions by In Vivo Chromatin Immunoprecipitation in Yeast

    Methods in Molecular Biology 809: 149-56

  • Rienzo A, Pascual-Ahuir A, Proft M (2012)
    The use of a real-time luciferase assay to quantify gene expression dynamics in the living yeast cell

    Yeast 29: 219-231

  • Montañés FM, Pascual-Ahuir A, Proft M (2011)
    Repression of ergosterol biosynthesis is essential for stress resistance and is mediated by the Hog1 MAP kinase and the Mot3 and Rox1 transcription factors

    Molecular Microbiology 79: 1008-23

  • Vendrell A, Martínez-Pastor M, González-Novo A, Pascual-Ahuir A, Sinclair DA, Proft M, Posas F (2011)
    Sir2 histone deacetylase prevents programmed cell death caused by sustained activation of the Hog1 stress-activated protein kinase

    EMBO Reports 12: 1062-1068

. (2016)
.
.
Entidad financiadora: 
MICINN
IP: 
Markus Proft
Entidad financiadora: 
MICINN
IP: 
Markus Proft
Entidad financiadora: 
MICINN (Proyectos intramurales)
IP: 
Markus Proft
Entidad financiadora: 
Consellería de Empresa, Universidad y Ciencia, Valencia.
IP: 
Markus Proft
Entidad financiadora: 
MEC
IP: 
Markus Proft
Entidad financiadora: 
Generalitat Valenciana
IP: 
Markus Proft
Entidad financiadora: 
Human Frontiers Science Program
IP: 
Amparo Pascual-Ahuir
Título: 
No hay datos sobre las patentes del grupo
Optimización de la detección de daños oxidativos en la célula viva y en tiempo real.
Año: 
2014
Nombre: 
Carolina Bets Plasencia
Universidad: 
Universitat Politècnica de València
Dirigida por: 
Amparo Pascual-Ahuir, Markus Proft
Tipo: 
Trabajos de Fin de Carrera
Estudio en tiempo real de la dinámica y memoria transcripcional en la adaptación a estrés.
Año: 
2014
Nombre: 
Daniel Poveda Huertes
Universidad: 
Universitat Politècnica de València
Dirigida por: 
Amparo Pascual-Ahuir, Markus Proft
Tipo: 
Trabajos de Fin de Carrera
Dinámica transcripcional en respuesta a estrés osmótico en Saccharomyces cerevisiae.
Año: 
2014
Nombre: 
Mª Elena Vanacloig Pedrós
Universidad: 
Universitat Politècnica de València
Dirigida por: 
Amparo Pascual-Ahuir, Markus Proft
Tipo: 
Trabajos de Fin de Carrera
Desarrollo y aplicación de un sistema integrativo de luciferasa para la cuantificación de la expresión génica in vivo.
Año: 
2014
Nombre: 
Sandra Saiz Balbastre
Universidad: 
Universitat Politècnica de València
Dirigida por: 
Amparo Pascual-Ahuir, Markus Proft
Tipo: 
Trabajos de Fin de Carrera
Monitorización en tiempo real de la expresión génica: empleo de la levadura como modelo para definir parámetros cuantitativos de la respuesta a estrés osmótico y oxidativo.
Año: 
2013
Nombre: 
Laura Dolz Edo
Universidad: 
Universitat Politècnica de València
Dirigida por: 
Amparo Pascual-Ahuir, Markus Proft
Tipo: 
Trabajos de Fin de Carrera
Papel de la composición de esfingolípidos en los procesos de respiración y adaptación a estrés.
Año: 
2013
Nombre: 
Sara Manzanares Estreder
Universidad: 
Universitat Politècnica de València
Dirigida por: 
Amparo Pascual-Ahuir, Markus Proft
Tipo: 
Tesis de Master
Estudio de la función y regulación de proteínas de la membrana externa de la mitocondria durante la adaptación a estrés oxidativo en levadura.
Año: 
2012
Nombre: 
Manzanares Estreder, Sara
Universidad: 
Universitat Politècnica de València
Dirigida por: 
Amparo Pascual-Ahuir, Markus Proft
Tipo: 
Trabajos de Fin de Carrera
Análisis de la función y regulación de una familia de proteínas mitocondriales en levadura relacionadas con la proteína de cerebro humana BRP44.
Año: 
2012
Nombre: 
Alba Timón Gómez
Universidad: 
Universitat Politècnica de València
Dirigida por: 
Amparo Pascual-Ahuir, Markus Proft
Tipo: 
Tesis de Master
Análisis de la función y la regulación de la mitocondria de la levadura Saccharomyces cerevisiae en respuesta a estrés osmótico.
Año: 
2011
Nombre: 
Mar Martínez Pastor
Universidad: 
Universitat Politècnica de València
Dirigida por: 
Amparo Pascual-Ahuir, Markus Proft
Tipo: 
Tesis Doctorales
Estudio de los mecanismos de la adaptación de la mitocondria a estrés salino en Saccharomyces cerevisiae.
Año: 
2011
Nombre: 
Paula Ruiz Hueso
Universidad: 
Universitat Politècnica de València
Dirigida por: 
Amparo Pascual-Ahuir, Markus Proft
Tipo: 
Trabajos de Fin de Carrera